index - Microbial Genome Annotation & Analysis Platform (MAGE) Accéder directement au contenu

Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

222

NOMBRE DE NOTICES

72

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

87 %

MOTS CLES

Oxidative stress Natural products Microbiology Comparative genomics Hydrothermal Agrobacterium tumefaciens Virulence factors Proteomics Directed evolution Adaptation Fish-pathogenic bacteria Acinetobacter baumannii Metagenomics Symbiosis Genomes Genomics Secondary metabolites Bacteroidetes Bactérie Acid mine drainage AMD Activated sludge Virulence Anaerobic Genome-scale metabolic networks Magnetotactic bacteria Food Gene regulation Lactic acid bacteria Fish pathogens Betaproteobacteria Nitrogen fixation Lactobacillus Magnetotaxis Flavobacterium psychrophilum Formate assimilation Phylogeny Mobile genetic elements Genome evolution Nitrogen fixing Continuous culture Evolution Bioremediation Bacteriophage Dichloromethane HGT Horizontal gene transfer Rhizobium Polyphasic taxonomy Archaea Bacterial genetics Digital DNA-DNA hybridization Iron uptake Nitrification Escherichia coli Gut microbiota CTX-M-15 Genome mining Metabolism ESBL Average nucleotide identity Clostridioides difficile Functional annotation Pathogenicity Genome sequence Complete genome Thermophile Arsenic Insect Dehalogenation Cyanobacteria Holobiont Marine bacteria Bacteriocin Bacterial Biodiversity Molecular evolution Experimental evolution Brochothrix thermosphacta Metabolic networks DDDH Microbial genomics Genome Heavy metal resistance Coevolution Mineral weathering ACL Transcriptome Transcriptomics Fish pathogen Alkaline thermal spring Fitness cost Functional genomics Pangenome Flavobacteriaceae Actinorhizal symbiosis Bacteria Biofilm Aquaculture Metabolomics Legume-rhizobium symbiosis